diff --git a/scene/main/viewport.cpp b/scene/main/viewport.cpp
index 26128a08ab3..d6dd8716640 100644
--- a/scene/main/viewport.cpp
+++ b/scene/main/viewport.cpp
@@ -1429,7 +1429,7 @@ void Viewport::_gui_show_tooltip() {
 	Control *tooltip_owner = nullptr;
 	gui.tooltip_text = _gui_get_tooltip(
 			gui.tooltip_control,
-			gui.tooltip_control->get_global_transform().xform_inv(gui.last_mouse_pos),
+			gui.tooltip_control->get_global_transform_with_canvas().affine_inverse().xform(gui.last_mouse_pos),
 			&tooltip_owner);
 	gui.tooltip_text = gui.tooltip_text.strip_edges();
 
@@ -1909,7 +1909,7 @@ void Viewport::_gui_input_event(Ref<InputEvent> p_event) {
 
 				if (gui.tooltip_popup) {
 					if (gui.tooltip_control) {
-						String tooltip = _gui_get_tooltip(over, gui.tooltip_control->get_global_transform().xform_inv(mpos));
+						String tooltip = _gui_get_tooltip(over, gui.tooltip_control->get_global_transform_with_canvas().affine_inverse().xform(mpos));
 						tooltip = tooltip.strip_edges();
 
 						if (tooltip.is_empty() || tooltip != gui.tooltip_text) {